重庆中心城区是重庆市交通网络的中心，亦是西南地区综合交通枢纽，内河港航、航空、铁路、城市轨道交通、索道交通、公共交通电梯、快速公交、内外环高速公路一应俱全。辖区内有客运特等火车站重庆西站和重庆北站，一等站重庆站，二等站沙坪坝站。
铁路交通
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重庆中心城区内正在新建扩建改建的有四座大型客运火车站，分别为位于渝中区的重庆站、位于渝北区（两江新区）的重庆北站、位于沙坪坝区的重庆西站和沙坪坝站。
轨道交通
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重庆轨道交通规划主要位于中心城区内，少数线路规划至主城新区。
重庆地铁与跨座式单轨属重庆市轨道交通(集团)有限公司运营管理。重庆轨道交通系统运营里程在中西部遥遥领先，截止2021年1月，重庆市轨道交通已开通环、1、2、3、4、5、6、国博、10号线，总运营里程运营里程370公里，位居中西部第二、全国第八。
目前，重庆市共有8条轨道交通线投入运营，最先投入运营的是于2005年建成、穿越中心城区渝中区和九龙坡区、大渡口区的轨道交通2号线，它是中国西部地区第一条城市轨道交通线，也是中国第一条跨座式单轨。轨道交通1号线和3号线分别于2011年先后投入运营，轨道交通6号线首段于2012年9月开通运营，轨道交通6号线国博支线一期于2013年5月15日开通运营。2016年12月28日，3号线北延伸段（空港线）碧津至举人坝段开通试运营。2017年12月28日，10号线鲤鱼池至王家庄段和5号线园博中心至大石坝段开通试运营。2018年12月28日，环线重庆图书馆经重庆北站南广场至海峡路段和4号线重庆北站北广场至唐家沱段开通试运营。
2018年11月，国家发改委正式批复了重庆轨道交通第三轮建设规划，获批规划项目共3个，全长70.51千米。
索道交通
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重庆是中国大陆唯一一个有公交索道系统的城市。目前重庆有长江索道在运行中，属重庆市客运索道有限公司管辖。另一条过江索道嘉陵江索道则于2011年3月1日停运，随后被拆除。
1982年1月1日，中国第一条城市跨江客运索道——嘉陵江客运索道建成试通车。这条于1980年12月15日动工的索道，全长740米，车厢最大容量46人，最大牵引速度6.5米/秒，总投资378万元。通车后，江北区和市中区（现渝中区）的人们出行便利了，重庆市旅游业也增加了一个新景点。当时，索道日客流量最大达到25400人次。2011年2月28日晚7点35分，嘉陵江索道江北城站迎走最后一批乘客，嘉陵江索道的通行史正式告一段落。
其中，长江索道是重庆市第二条跨江索道，它于1987年10月建成投入运行。该索道起于渝中区长安寺（新华路）横跨长江至南岸区的上新街（龙门浩），全长1166米，日运客1.05万人次。有万里长江第一条空中走廊之称。索道上可以看见渝中半岛、长江还有江北等地。
航空
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重庆中心城区有重庆江北国际机场，是重庆四座民用航空机场之一，也是最大的一座。重庆江北国际机场有飞往国内各大城市和国际/地区16个航点的航班，是重庆航空、西部航空、华夏航空的主基地机场和中国南方航空、四川航空、中国国际航空的基地机场，同时也是中西部地区最繁忙的机场之一。重庆江北国际机场拥有T2A、T2B国内航站楼和T3A国内及国际航站楼以及保税物流航站，并配套有江北机场物流保税区、空港国际保税区，是非沿海地区唯一的一个机场配属保税区，也是中西部地区第一个航空物流保税园区。重庆江北国际机场是全国净空飞行密度最高的一个机场之一。
2017年8月29日，重庆江北国际机场T3A及第三跑道正式启用，使机场成为中国中西部地区首个拥有三座航站楼、实现三条跑道同时运行的机场。同时，江北国际机场还有驳接重庆另外两座机场万州五桥机场和黔江武陵山机场的机场班车。
桥梁
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由于重庆主城区地势多水，长江、嘉陵江贯穿市区而过，因此重庆主城区的巨型桥梁数量与密度远远高于其他城市。
重庆中心城区的第一座大型跨江公路桥是1958年开工、1966年完工的牛角沱嘉陵江大桥。而重庆中心城区的第一座跨长江公路桥是1977年动工、1980年完工的石板坡长江大桥。在随后的30年多中，重庆中心城区的跨长江桥梁数量已经有五十多座长江大桥和嘉陵江大桥。
重庆中心城区大型跨江桥梁
注：自下游到上游、复线桥与轨道交通专用桥分开计算，公轨两用桥只算一座。
长江上的大桥：（截至2021年2月底共17座）
鱼嘴两江大桥（绕城高速）
寸滩长江大桥
大佛寺长江大桥（内环快速路）
朝天门长江大桥（世界第二拱桥）（公轨两用桥）
东水门长江大桥（公轨两用桥）
石板坡长江大桥（重庆中心城区首座跨长江公路桥）
石板坡长江大桥复线桥
菜园坝长江大桥（世界首座公轨两用桥）
鹅公岩长江大桥
鹅公岩轨道专用长江大桥（轨道桥）
李家沱长江大桥
马桑溪长江大桥（内环快速路）
鱼洞长江大桥（世界首座同桥面公轨两用桥）
新白沙沱长江大桥（铁路桥）（世界首座双层六线铁路斜拉桥）
地维长江大桥
外环江津长江大桥
鼎山长江大桥（公轨两用斜拉桥）
嘉陵江上的大桥：（截至2021年2月底共27座）
千厮门嘉陵江大桥（公轨两用桥）
黄花园嘉陵江大桥
曾家岩嘉陵江大桥
重庆嘉陵江大桥（重庆主城区首座大型跨江公路桥）
渝澳嘉陵江大桥
渝澳嘉陵江大桥轨道专用桥（轨道桥）
华村嘉陵江大桥
石门嘉陵江大桥
高家花园轨道大桥（轨道桥）
高家花园嘉陵江大桥（内环快速路）
双碑嘉陵江大桥
渝怀铁路井口嘉陵江大桥（铁路桥）
兰渝铁路新井口嘉陵江大桥（铁路桥）（四线铁路桥）
马鞍石嘉陵江大桥（兰海高速）
蔡家嘉陵江大桥轨道交通专用桥（轨道桥）
嘉悦嘉陵江大桥（国内最大跨度矮塔斜拉梁桥）
水土嘉陵江大桥（绕城高速）
遂渝铁路嘉陵江大桥（铁路桥）
遂渝铁路嘉陵江大桥复线桥（铁路桥）
襄渝铁路嘉陵江大桥（铁路桥）
兰渝铁路嘉陵江大桥（铁路桥）
新朝阳嘉陵江大桥
碚东嘉陵江大桥
北碚嘉陵江大桥（兰海高速）
遂渝铁路草街嘉陵江大桥（铁路桥）
遂渝铁路草街嘉陵江大桥复线桥（铁路桥）
草街电站大桥